据南京农业大学园艺学院副教授王海滨介绍，菊花黑斑病在种植时间较久的花田比较常见，主要是影响叶片。前期发病基本可以控制。但经验则极易产生严重的后果，可能会造成绝收。
南京农业大学菊花遗传育种与分子生物学实验室陈发棣教授领衔的研究团队，在国家自然科学基金，江苏省自然科学基金、中央高校基本科研业务费等项目的资助下，以抗病和感病的菊花品种为研究对象，在病菌侵染早期（未形成病斑阶段），侵染中期（病斑形成阶段）和侵染后期（病斑扩展蔓延阶段），对菊花叶片取样，通过高通量测序鉴定了一系列菊花响应黑斑病菌侵染的差异表达基因，在高通量测序分析的基础上，结合权重基因共表达网络分析、荧光定量PCR和菊花遗传转化实验，绘制了菊花响应黑斑病菌侵染的免疫时序图。
研究发现，在病菌侵染早期，钙信号、EDS1介导的免疫反应被激活；随着病斑的形成，更多的植物免疫反应发挥作用，尤其是乙烯信号介导的免疫反应；在侵染后期，鉴定了一系列菊花免疫反应的核心基因，包括多药抗性蛋白，丰富了菊花抗病分子机理。
据陈发棣教授介绍：菊花黑斑病的典型症状是：发病初期叶片上零星分散着很小的、褐色的坏死斑点，随后病斑逐渐扩大，形成圆形、椭圆形或不规则形的黑色病斑，并会出现同心环一样的轮纹。受侵染植物的生长通常受到抑制，花朵也会变小、变少，而且花型扭曲，导致干枯、脱落甚至死亡，给生产造成严重损失。“菊花黑斑病在高温高湿的环境下，危害尤为严重。该研究明确菊花抗黑斑病的机理，可为黑斑病抗性育种和有效防治提供理论指导。”陈发棣教授说。
2020年3月，《园艺研究》在线发表了该团队题为“通过对感染黑斑病的菊花叶片的基因表达图谱分析，揭示了其防御机制的不同阶段”的研究论文。《园艺研究》是由南京农业大学与Nature出版集团合作创办的英文期刊，是Nature旗下唯一一本园艺领域专刊，也是目前园艺领域唯一一本一区中国SCI期刊。
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